86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4037 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  100 
 
 		 339 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.54 
 
 		 662 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.23 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  31.19 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  32.13 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.02 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  30.04 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.14 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  32.12 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.54 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  31.16 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  29.27 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.24 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  28.87 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  30.61 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  29.91 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  29 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.96 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  25 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  26.54 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  26.21 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  25.39 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  27.61 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  23.33 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.17 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.45 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  24.47 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.86 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  23.84 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3501  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.897036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  25 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  25 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  24.12 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.47 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  21.77 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  32.76 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  28.37 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  28.37 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.34 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.34 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  23.44 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>