167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3319 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  100 
 
 
315 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  99.05 
 
 
315 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3438  periplasmic binding protein  86.03 
 
 
315 aa  564  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3010  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.81 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  30.56 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  31.02 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  30.73 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  30.28 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.09 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  28.35 
 
 
662 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  30.28 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  30.14 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  30.14 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  30.14 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.45 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.45 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.45 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.45 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.45 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.45 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  29.63 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.09 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  29.49 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.09 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  27.37 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  30.19 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.44 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.83 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  28.52 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.3 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.2 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
331 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.6 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3141  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  31.97 
 
 
346 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000696351  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0374  ferrichrome ABC transporter substrate-binding protein  24.63 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  27.39 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  25.42 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  28.51 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  25 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  26.72 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.42 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.26 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  37.14 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  26.87 
 
 
314 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  26.41 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.04 
 
 
347 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.14 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
305 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.11 
 
 
317 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.14 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.14 
 
 
312 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  23.11 
 
 
317 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  23.11 
 
 
317 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  28.81 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.14 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  28.81 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.81 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.14 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.81 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.14 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  28.81 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.14 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  26.87 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  23.04 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.21 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.14 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  25 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.11 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.58 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  25 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2309  periplasmic binding protein  22.9 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0301481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2351  periplasmic binding protein  22.9 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.570378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  27.19 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0871  periplasmic binding protein  30.38 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  24.45 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  31.4 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  30.09 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  27.75 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  27.75 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.37 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.6 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.6 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.6 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.75 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>