37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 331 aa  676    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3141  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.66 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000696351  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1624  periplasmic binding protein  35.43 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2552  periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2741  periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100238  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4297  periplasmic binding protein  31.75 
 
 		 353 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000180062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  25.6 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  29.6 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  29.6 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3438  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  21.82 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  24.75 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  24.75 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.82 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  31.11 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.55 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.17 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.86 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.17 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.17 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.17 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.17 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.3 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.17 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46929  predicted protein  23.79 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  20.06 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  34.26 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  34.12 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>