143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3045 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  100 
 
 
328 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.02 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.017194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5108  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  31.4 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599294  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3786  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
327 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  29.08 
 
 
361 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  28.86 
 
 
340 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.11 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  29.57 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  35.58 
 
 
662 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.37 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.27 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.11 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.11 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  34.08 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.71 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  27.98 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.21 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  28.5 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.71 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.11 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.81 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.81 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.81 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.81 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.32 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.81 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2666  periplasmic binding protein  28.76 
 
 
222 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000160035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  30.73 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  32.72 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  28.65 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  31.37 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.6 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  27.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  27.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  27.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  30.34 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.02 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.02 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  25.25 
 
 
314 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  32.3 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  30.41 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  30.41 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  27.67 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  27.67 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.25 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  30.67 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  30.67 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.59 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.12 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  24.84 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.29 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.05 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.4 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.4 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.4 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.87 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.4 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.4 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.25 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.4 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.87 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.37 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.37 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.21 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.34 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.37 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  28.16 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  29.91 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  25.87 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  25.4 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  23.81 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.69 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  25.87 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.81 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  30.87 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  25.7 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  36.67 
 
 
352 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  31.49 
 
 
316 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.16 
 
 
336 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.48 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  26.11 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  28.42 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  28.42 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  28.65 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  31.51 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  25.91 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.65 
 
 
348 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  28.48 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>