93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2723 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  100 
 
 		 340 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  69.14 
 
 		 326 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.017194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3786  periplasmic binding protein  68.63 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5108  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  65.36 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599294  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  31.18 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.15 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.81 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.21 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  31.54 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.54 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  31.54 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.54 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.54 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.54 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.54 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  30.87 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.86 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.86 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  32.64 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.87 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.35 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.03 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.4 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.4 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.4 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.4 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  30.9 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.73 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.73 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.15 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.26 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  35.03 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  27.15 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.71 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.3 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  32.43 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  24.74 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.62 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 662 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.05 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.3 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.9 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.3 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  24.23 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  24.23 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.23 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.23 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  24.23 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  23.49 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  23.49 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.31 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 671 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.12 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  30.13 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  30.3 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0374  ferrichrome ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  26.4 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  23.46 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.6 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.62 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.11 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  24.32 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>