278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2491 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  100 
 
 		 316 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  43.04 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  32.1 
 
 		 662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.43 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.56 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  30.55 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  33.09 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.64 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.29 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.29 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.29 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.29 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.29 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.29 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.29 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  29.64 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.29 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  27.94 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  27.94 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  27.94 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  27.94 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  29.93 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  30.29 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.57 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  30.8 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.89 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  30.8 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  30.97 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  29 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  28.83 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  26.3 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  26.3 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.88 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.55 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.03 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.73 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  28.46 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.01 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.01 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.01 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.01 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  25.84 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  25.84 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  29.28 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  25 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  27.68 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0425065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>