More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2590 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  68.63 
 
 		 272 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  58.74 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  60.84 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  50.78 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  48.47 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  38.24 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  38.24 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  30.04 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  29.63 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28.09 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.26 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.93 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.72 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28.09 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  29.04 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.72 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  29.04 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  29.04 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  29.04 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  32.71 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  28.57 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  35.23 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  28.21 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  27.84 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  26 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  31.32 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30.88 
 
 		 662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  30.22 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 331 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.52 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  30.24 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 346 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.84 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  31.09 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 306 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.55 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  30.34 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  30.34 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  29.96 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  29.37 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  30.94 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  25 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  25 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.95 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  30.11 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.68 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  27.34 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3485  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  23.35 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.24697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.35 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3501  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.35 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.67568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3472  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.02 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  24.54 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.54 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3245  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  22.57 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000144185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3185  periplasmic binding protein  22.57 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3275  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.57 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3531  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.57 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3489  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.57 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>