More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2409 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  100 
 
 
333 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
662 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  32.11 
 
 
324 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  34.25 
 
 
324 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  30.84 
 
 
348 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  33.03 
 
 
300 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  33.55 
 
 
331 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  32.87 
 
 
319 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.57 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.57 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  30.1 
 
 
322 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.53 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.93 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.93 
 
 
322 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.1 
 
 
321 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.76 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.18 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.18 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  31.38 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  29.88 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  32.29 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.48 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  27.74 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  27.55 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  27.55 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  27.55 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  28.66 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  27.55 
 
 
320 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  27.27 
 
 
320 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.55 
 
 
320 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
316 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  33.22 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  27.84 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  32.19 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  32.17 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  30.53 
 
 
298 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.66 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
330 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
330 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
316 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  27.82 
 
 
306 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.42 
 
 
313 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
329 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  30.07 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  30.98 
 
 
309 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.62 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.55 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.3 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.36 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  31.19 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.23 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.33 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  22.98 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  25.96 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  22.65 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  22.9 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  29.03 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.01 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.09 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  28.06 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.71 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  27.48 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  23.24 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  24.23 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.23 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  24.23 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  24.23 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.87 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.23 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  23.24 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.44 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.05 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.96 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.96 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
365 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  25.26 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  22.94 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  25.26 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.08 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.56 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>