More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7985 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  100 
 
 		 336 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  49.82 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  46.04 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  42.07 
 
 		 662 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  43.04 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  40.5 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  39.78 
 
 		 300 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  37.66 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  35.99 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  35.17 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.92 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.92 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  36.93 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  36.93 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  36.93 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  37.11 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  36.93 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  36.59 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  36.77 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.24 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  34.83 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  36.93 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  36.24 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  36.59 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  33.93 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.95 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.72 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  33.92 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.05 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  33.63 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.63 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  35.13 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  35.13 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  33.22 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  31.8 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  32.53 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  33.9 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.22 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.19 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  31.31 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.52 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  31.51 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.96 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.76 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  30.9 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.76 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.2 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.2 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.2 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.2 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  31.06 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.2 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  31.06 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  31.06 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.54 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  32.17 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  29.25 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  29.25 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  29.25 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  30.58 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.91 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  32.73 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  31.37 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  31.19 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.19 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  31.52 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.91 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  30.63 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 351 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  30.26 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  31.1 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.26 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  30.26 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  30.26 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.26 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  30.26 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.43 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.76 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  34.53 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  30.23 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  28.83 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.42 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>