More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2122 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  100 
 
 
298 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  56.36 
 
 
306 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  55.64 
 
 
324 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  55.64 
 
 
324 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  51.81 
 
 
322 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  52.17 
 
 
321 aa  322  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  52 
 
 
321 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  52 
 
 
321 aa  322  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  51.45 
 
 
322 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  51.81 
 
 
321 aa  321  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  51.81 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  51.64 
 
 
321 aa  318  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  51.64 
 
 
321 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  51.64 
 
 
321 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  50.36 
 
 
320 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  50.36 
 
 
320 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  50 
 
 
320 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  50 
 
 
320 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  50 
 
 
320 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  50 
 
 
305 aa  299  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  50 
 
 
320 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  49.64 
 
 
320 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  49.28 
 
 
321 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  49.28 
 
 
320 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  46.52 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  44.2 
 
 
662 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  42.28 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  38.54 
 
 
309 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  40.27 
 
 
300 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  37.01 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  38.65 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  34.98 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  35.9 
 
 
346 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  39.02 
 
 
329 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  35.29 
 
 
313 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  35.64 
 
 
316 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  33.11 
 
 
330 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  33.11 
 
 
330 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  33.69 
 
 
331 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  33.1 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  32.99 
 
 
329 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  32.71 
 
 
301 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  32.42 
 
 
348 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  30.55 
 
 
314 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  30 
 
 
313 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
305 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.14 
 
 
314 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.14 
 
 
314 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.14 
 
 
314 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.36 
 
 
312 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.14 
 
 
314 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  30.18 
 
 
314 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.36 
 
 
312 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.14 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.14 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  29.82 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  29.82 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.82 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  29.29 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  29.82 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.82 
 
 
314 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
317 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.44 
 
 
331 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.43 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  30.53 
 
 
333 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  24.29 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  24.29 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  32.6 
 
 
380 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  30.66 
 
 
358 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  27.36 
 
 
313 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.44 
 
 
326 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  31.21 
 
 
311 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  28.82 
 
 
312 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.43 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  28.12 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  24.82 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29.27 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  30.18 
 
 
359 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
327 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
335 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
327 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  29.08 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  25.62 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.62 
 
 
300 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  25.62 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  25.62 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  29.54 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3185  periplasmic binding protein  26.56 
 
 
302 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.27 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>