297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7292 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  43.04 
 
 
316 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  29.01 
 
 
320 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  29.01 
 
 
320 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  28.7 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  28.7 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  28.7 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  28.7 
 
 
320 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  29.54 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  30.06 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  28.4 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  32.43 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.05 
 
 
321 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.05 
 
 
321 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  31.05 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.69 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.69 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
324 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  31.29 
 
 
324 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  32.13 
 
 
662 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.84 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.84 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  30.69 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  30.69 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  32.73 
 
 
336 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.32 
 
 
321 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.96 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
319 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  28.76 
 
 
348 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  31.21 
 
 
298 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
306 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
331 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  30.32 
 
 
329 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  29.78 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  29.63 
 
 
342 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  30.94 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  28.96 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.35 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.25 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.25 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.35 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.35 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.35 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.35 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  25.16 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.21 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2421  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.58 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231407  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  25.41 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  26.79 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  28.32 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.21 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  26.98 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.24 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  25.67 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.86 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.86 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.86 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.24 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.86 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  24.54 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.86 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  25.67 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  25.4 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.86 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  24.77 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3438  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.86 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.09 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.21 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.29 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  24.07 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  24.83 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.65 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  28.86 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  24.36 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  28.44 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>