296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1864 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  100 
 
 
361 aa  727    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.71 
 
 
326 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.017194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3786  periplasmic binding protein  30.97 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  30.82 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5108  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.91 
 
 
331 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599294  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.84 
 
 
347 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.79 
 
 
322 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  29.28 
 
 
316 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
662 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.48 
 
 
322 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  29.08 
 
 
328 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.82 
 
 
345 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.55 
 
 
321 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.55 
 
 
321 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.8 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  27.1 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.84 
 
 
321 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  33.75 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.52 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.52 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.2 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  27.13 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  28.79 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  27.52 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.52 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.1 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  26.61 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  27.22 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  27.22 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  27.22 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  26.03 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  26.03 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.5 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.83 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  30.09 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  26.99 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  27.05 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.7 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  30.5 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  28.32 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1624  periplasmic binding protein  27.81 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.7 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  24.84 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
335 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  24.46 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  27.94 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.87 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.87 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.46 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.79 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.87 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  24.89 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  27.2 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  26.99 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.52 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.52 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.52 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.52 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  24.53 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  27.74 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.52 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.57 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.63 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.3 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.3 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.3 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.3 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  24.33 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.52 
 
 
305 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.3 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  23.56 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  23.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  23.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  23.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  26.76 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.97 
 
 
347 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  23.11 
 
 
314 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  35.81 
 
 
322 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  25.79 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  26.82 
 
 
316 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.22 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>