226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0698 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  100 
 
 
359 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  99.44 
 
 
359 aa  740    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  99.44 
 
 
359 aa  740    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  55.41 
 
 
319 aa  347  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  51.92 
 
 
348 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  48.87 
 
 
351 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.59 
 
 
318 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.59 
 
 
318 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.59 
 
 
318 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.59 
 
 
318 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.59 
 
 
318 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  50.88 
 
 
362 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  53.58 
 
 
318 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  53.58 
 
 
318 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.14 
 
 
319 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  325  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.58 
 
 
318 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4084  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  40.48 
 
 
320 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00166295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.11 
 
 
337 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  34.38 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  40.33 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.55 
 
 
301 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.9 
 
 
312 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1804  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3150  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  34.42 
 
 
362 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00953436  hitchhiker  0.00000000531618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.45 
 
 
325 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  26.96 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  25.79 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  25.74 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.25 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  34.57 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  24.75 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.75 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.75 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  24.75 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  24.75 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  24.75 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  25.45 
 
 
662 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  25.97 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  28.48 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  26.59 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.59 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  26.59 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.02 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
312 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  21.53 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  23.81 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.99 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  23.36 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  24.26 
 
 
315 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  25.4 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.14 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.65 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  23.17 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.14 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  30.73 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  25.23 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.91 
 
 
305 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.65 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.38 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.36 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  25.12 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  28.86 
 
 
351 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  23.11 
 
 
320 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  24.12 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  31.33 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  24.76 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.6 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.74 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.73 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.57 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  25.11 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.64 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  24.36 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  24.36 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1393  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  23.31 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.178011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25 
 
 
348 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  21.71 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.53 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.75 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.75 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>