71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1624 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1624  periplasmic binding protein  100 
 
 		 338 aa  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2741  periplasmic binding protein  49.71 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100238  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4297  periplasmic binding protein  50.58 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000180062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2552  periplasmic binding protein  46.76 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.43 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3141  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  27.96 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000696351  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  28.11 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.02 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.46 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  23.7 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.83 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46929  predicted protein  25.53 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.58 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.08 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  26.24 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.08 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.08 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.53 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  26.11 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  26.11 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.91 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.05 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.22 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.08 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  26.24 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.08 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.22 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.08 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.2 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.2 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  30.9 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  26.11 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.11 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.11 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.75 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  26.11 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  26.11 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 662 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.47 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.75 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  35 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.54 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.54 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.54 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.54 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.78 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3010  periplasmic binding protein  31.15 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.54 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  25.3 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.02 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.017194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>