39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3141 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3141  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 346 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000696351  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.2 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1624  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2552  periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2741  periplasmic binding protein  28.69 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100238  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4297  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000180062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  26.2 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  31.97 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3438  periplasmic binding protein  32.5 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  31.29 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.72 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  33.1 
 
 		 723 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  33.1 
 
 		 723 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  34.09 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.82 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.82 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.82 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.82 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.82 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.82 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2351  periplasmic binding protein  32.87 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.570378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2309  periplasmic binding protein  32.87 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0301481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.38 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.38 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 328 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  22.43 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 682 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  34.48 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 682 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3786  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>