134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3531 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 312 aa  618  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4084  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  54.83 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00166295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  59.41 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3150  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  56.83 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00953436  hitchhiker  0.00000000531618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1804  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  52.75 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  48.06 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  40.13 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.08 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.08 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.08 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.08 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.78 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.64 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.64 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.46 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  40.76 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.279862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  38.64 
 
 		 318 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  38.64 
 
 		 318 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  38.31 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.31 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.31 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.96 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  43.99 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.76 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.56 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.18 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.76 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  34.24 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  34.24 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.9 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.91 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  21.09 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  31.93 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  32.86 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.53 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3472  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.05 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1393  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  21.59 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.178011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3185  periplasmic binding protein  22.82 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3501  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.67568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  21.53 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.44 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.34 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  23.19 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.74 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  33.02 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  33.02 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.56 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  19.26 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  22.54 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  18.75 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.91 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  18.75 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  18.75 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  34.44 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  19.26 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  19.12 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  18.75 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  18.75 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3485  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  22.03 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.24697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  22.33 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.86 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  22.73 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  28.44 
 
 		 361 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  20.45 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  21.45 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  22.51 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  18.38 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  34.84 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  18.38 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  23.28 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  23 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>