104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 326 aa  656    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.017194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5108  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  71.38 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599294  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3786  periplasmic binding protein  72.5 
 
 		 327 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  70.61 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  33.02 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  31.71 
 
 		 361 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.39 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.88 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  34.93 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.41 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.19 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.19 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.19 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.19 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.19 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.19 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.88 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  31.6 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.35 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.35 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  25.25 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.16 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  24.92 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.29 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.29 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.92 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.29 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  24.92 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.29 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.68 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.25 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.68 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  24.92 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.11 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.39 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.59 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.15 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.29 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.29 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.22 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  25.96 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.62 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.44 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0374  ferrichrome ABC transporter substrate-binding protein  25.61 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.31 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 723 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.31 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.32 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  35.76 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 723 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.01 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  36.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3010  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.62 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  29.02 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.4 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  34.21 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2666  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000160035  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  22.88 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  26.06 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  38.1 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  28.63 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.64 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  31.36 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.73 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>