238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2207 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  100 
 
 
335 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  33.65 
 
 
662 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.62 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.49 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.59 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.28 
 
 
322 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.45 
 
 
321 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.45 
 
 
321 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
310 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.85 
 
 
321 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.85 
 
 
321 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
322 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  32.72 
 
 
300 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
319 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.9 
 
 
321 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.33 
 
 
324 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.9 
 
 
321 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
324 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.9 
 
 
321 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.64 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.64 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  25.64 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.64 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  25.64 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  24.62 
 
 
320 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  24.24 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  24.92 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  24.92 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  24.92 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  24.32 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  24.32 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25 
 
 
314 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  27.63 
 
 
317 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  25.32 
 
 
314 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  25.23 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  32.32 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  24.4 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.85 
 
 
336 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  24.25 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.4 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  25.74 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.47 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  29.45 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
315 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  33.83 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  23.3 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.68 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0374  ferrichrome ABC transporter substrate-binding protein  24.25 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  24.47 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.9 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  27.6 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  22.78 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  22.78 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.45 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.45 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.45 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.45 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.78 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.78 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.78 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  24.75 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  28.84 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.62 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  28.84 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.42 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.75 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.67 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.84 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.75 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  25.39 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  27.42 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  22.36 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  22.36 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.4 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.41 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.41 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.41 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.41 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.41 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.01 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  24.17 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.53 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  24.42 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.53 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.53 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.53 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.79 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>