213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4907 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  100 
 
 
318 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  33.75 
 
 
361 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  22.22 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  23.57 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  28.43 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  23.73 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  30.41 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20820  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.6 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.017194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  29.26 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  23.25 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  25.17 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  22.93 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.67 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.93 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  22.93 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  27.18 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.22 
 
 
662 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  22.93 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.93 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.58 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.32 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.04 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  33.97 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  27.85 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5108  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.21 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599294  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  31.16 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.51 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3786  periplasmic binding protein  30.23 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.53 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  31.28 
 
 
323 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.53 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  27.67 
 
 
361 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  30.57 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  34.13 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.02 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  33.51 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.18 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.03 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.03 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  25 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.68 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.37 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  31.33 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  31.33 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  31.33 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  31.07 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
316 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.12 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.89 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.95 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  22.89 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.95 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  22.59 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.95 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  22.89 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.95 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.95 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.89 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.12 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  26.38 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0871  periplasmic binding protein  32.08 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.19 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  22.63 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  27.12 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  32.06 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.63 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3045  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.6 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  27.12 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  29.03 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  32.58 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  32.58 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.3 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3489  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.69 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3472  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.6 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.46 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  24.02 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3275  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.69 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3188  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  26.69 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3531  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.69 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.84 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.62 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.57 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.42 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3245  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  26.69 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000144185  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  25.98 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>