254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1499 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  100 
 
 
351 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  72 
 
 
348 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  65.62 
 
 
362 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  56.11 
 
 
319 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  49.15 
 
 
359 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  49.15 
 
 
359 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  57.19 
 
 
318 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  53.44 
 
 
318 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.19 
 
 
318 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  57.19 
 
 
318 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  54.29 
 
 
319 aa  349  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  56.85 
 
 
318 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  56.85 
 
 
318 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  56.85 
 
 
318 aa  348  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  48.87 
 
 
359 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  56.85 
 
 
318 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  56.85 
 
 
318 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  55.49 
 
 
318 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  55.49 
 
 
318 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  55.49 
 
 
318 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  55.49 
 
 
318 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  55.49 
 
 
318 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4084  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.46 
 
 
320 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00166295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.65 
 
 
337 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  40.79 
 
 
301 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1804  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.86 
 
 
299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3150  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.86 
 
 
362 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00953436  hitchhiker  0.00000000531618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.7 
 
 
330 aa  185  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  40.52 
 
 
338 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.25 
 
 
325 aa  175  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.08 
 
 
312 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  27.38 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  27.42 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  27.51 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  24.31 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.29 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.29 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.29 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.29 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.29 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  24.37 
 
 
662 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  25.3 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.77 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.74 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.23 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  29.86 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  20.3 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  20.3 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.48 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  25.48 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  25.48 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.74 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  20 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.1 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  20.12 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  20 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  20 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  19.27 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.18 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1393  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.178011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  25.62 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  33.83 
 
 
365 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  20.06 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  19.57 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  24.81 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  30.41 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  25 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  24.37 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  21.3 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  24.75 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  27.39 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  43.84 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.6 
 
 
314 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  26.21 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  24 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  24 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  24 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
308 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
404 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  23.86 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  21.22 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  27.82 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.41 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.41 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  27.42 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>