More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4784 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
345 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  94.97 
 
 
341 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  94.97 
 
 
341 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  85.8 
 
 
345 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  85.8 
 
 
345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  80.87 
 
 
344 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  94.97 
 
 
341 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  65.87 
 
 
342 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  59.16 
 
 
341 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  67.89 
 
 
429 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2421  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  68.15 
 
 
419 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  67.89 
 
 
398 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  67.56 
 
 
342 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  67.56 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  67.56 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  67.56 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  67.56 
 
 
398 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  66.3 
 
 
276 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  35.16 
 
 
300 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  34.4 
 
 
312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.83 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  31.52 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.47 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.47 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.47 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.47 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.47 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  31.86 
 
 
363 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  31.71 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
352 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  30.69 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
335 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.9 
 
 
319 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.71 
 
 
331 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  28.43 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  26.93 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  29.93 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.11 
 
 
305 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.52 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  27.18 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.47 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  27.02 
 
 
300 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
319 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
319 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  25.17 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
662 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  27.34 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  25.93 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.34 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  27.34 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.34 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.56 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.33 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  29.09 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0570173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  26.81 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.14 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  26.81 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.2 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  31.01 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.45 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  37.86 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  26.6 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.45 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.45 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  25.58 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  27.86 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.18 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.45 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.09 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.7 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.45 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  22.78 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  27.53 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.45 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.45 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  22.78 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  27.27 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  29.64 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  28.57 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.36 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  21.71 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.42 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  22.42 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  22.42 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.42 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>