126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0305 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  100 
 
 
325 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  51.9 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.85 
 
 
319 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.24 
 
 
301 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  35.8 
 
 
318 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4084  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.3 
 
 
320 aa  188  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00166295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.75 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  36.42 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.42 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.42 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  36.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  36.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.42 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.73 
 
 
312 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.83 
 
 
337 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.33 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.33 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.33 
 
 
318 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.77 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.33 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.01 
 
 
318 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1804  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.65 
 
 
299 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.74 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.25 
 
 
351 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3150  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.97 
 
 
362 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00953436  hitchhiker  0.00000000531618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  39.32 
 
 
338 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.33 
 
 
348 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.78 
 
 
359 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.78 
 
 
359 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.45 
 
 
359 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  24.39 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2309  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
302 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0301481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2351  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
302 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.570378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  21.02 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  22.78 
 
 
375 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.52 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.53 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  21.1 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.2 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.01 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.01 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.01 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.01 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.64 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.65 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.01 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.27 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  22.27 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  23.83 
 
 
662 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.26 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.88 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  23.17 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3501  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.91 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.67568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.91 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3472  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.91 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  24.46 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.82 
 
 
314 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  21.48 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  22.64 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.48 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3485  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  23.91 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.24697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.56 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.48 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.48 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  21.48 
 
 
321 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  24.81 
 
 
335 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3245  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  23.91 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000144185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  30.06 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  28.19 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.97 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.97 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.97 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.97 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  25.97 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1393  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  21.22 
 
 
310 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.178011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3438  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  25 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  24.53 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3489  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.57 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  24.15 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  21.84 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  28.95 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  24.15 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2723  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  24.74 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3188  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  23.77 
 
 
299 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  21.94 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  21.33 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  22.14 
 
 
362 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  21.31 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  23.27 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.83 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>