277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0640 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  100 
 
 		 337 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  33.64 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  32.05 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  31.95 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.18 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.15 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.47 
 
 		 662 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  29.24 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.68 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.68 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.15 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.84 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.81 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.7 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.7 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  22.7 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  24.67 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  23.44 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  22.7 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.92 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.51 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  23.15 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  22.39 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.81 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  24.04 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.55 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  29.75 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.39 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.39 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  25 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  28 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  22.71 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  22.71 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3185  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0079583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.6 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  22.6 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3583  periplasmic binding protein (iron-binding protein)  23.17 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  22.6 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.6 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  22.6 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3501  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.37 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.67568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.44 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.44 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.15 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.87 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2409  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  22.12 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3245  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  23.36 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000144185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3472  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.15 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.467464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.74 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.92 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.24 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3489  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.36 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  21.67 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  23.91 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3485  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  24.05 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.24697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.12 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 306 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.53 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.53 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>