More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1739 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  100 
 
 
352 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  52.76 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  45.24 
 
 
309 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  46.83 
 
 
312 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  42.95 
 
 
324 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  42.62 
 
 
324 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  42.62 
 
 
324 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  42.62 
 
 
324 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  42.62 
 
 
324 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  42.62 
 
 
324 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  42.62 
 
 
324 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  44.2 
 
 
300 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.57 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  32.42 
 
 
316 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  33.66 
 
 
335 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  32.34 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  32.08 
 
 
340 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  33.87 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.31 
 
 
296 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  30.61 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.8 
 
 
662 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  31.29 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  27.65 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  31.13 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.31 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  30.47 
 
 
308 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  29.79 
 
 
345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  30.17 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  29.1 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  30.32 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  30.32 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  30.5 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
345 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
324 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  29.07 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.99 
 
 
319 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.18 
 
 
308 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  28.79 
 
 
290 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.76 
 
 
322 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  28.88 
 
 
341 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
322 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.81 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.85 
 
 
276 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.76 
 
 
322 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.19 
 
 
321 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.19 
 
 
321 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
344 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.61 
 
 
301 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  30.32 
 
 
341 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.97 
 
 
321 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.97 
 
 
321 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.97 
 
 
321 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28.97 
 
 
321 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.15 
 
 
319 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28.97 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  29.46 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  32.74 
 
 
309 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.74 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.74 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  29.46 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.37 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  29.59 
 
 
259 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
296 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
303 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  30.92 
 
 
301 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  29.07 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.6 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.6 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.74 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.6 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.6 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  30.86 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  32.38 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.74 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.74 
 
 
429 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.36 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  26.48 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  29.18 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.03 
 
 
351 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
292 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2421  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  29.29 
 
 
419 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
333 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.46 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>