More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2464 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  100 
 
 
351 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  56.82 
 
 
340 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  40.48 
 
 
323 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  36.88 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  34.99 
 
 
316 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.56 
 
 
332 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  35.84 
 
 
330 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  33.73 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.51 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.51 
 
 
324 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.95 
 
 
324 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.95 
 
 
324 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.95 
 
 
324 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
324 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  29.41 
 
 
312 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  27.8 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  28.24 
 
 
302 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
308 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  24.48 
 
 
309 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  30.71 
 
 
292 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  29.57 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  24.67 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.05 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.74 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.74 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.83 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  26.3 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  27.95 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  28.32 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  29.27 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0570173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.37 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.54 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.71 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  26.69 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  22.68 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.71 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.71 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.71 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.54 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.71 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  25.36 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  25.36 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.36 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.9 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  24.17 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.6 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  21.66 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1305  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0754  FecB protein  22.74 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.036257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  23.83 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  25.18 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  21.88 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  24.47 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.85 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.85 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.85 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
662 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  24.48 
 
 
303 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  30.5 
 
 
318 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.78 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2421  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.85 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.52 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.52 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.52 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.52 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4802  periplasmic binding protein  23.83 
 
 
277 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.42 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  30 
 
 
318 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  22.69 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.13 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.19 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  23.37 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  22.22 
 
 
295 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.13 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.13 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.13 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.59 
 
 
429 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  20 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
297 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2777  periplasmic binding protein  25.61 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  23.27 
 
 
300 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  23.2 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  23.16 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>