245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2782 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  100 
 
 		 301 aa  577  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  52.12 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  44.12 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  41.5 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  42.05 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  39.47 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  40.71 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  38.16 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  40.66 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4802  periplasmic binding protein  38.17 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  35.27 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  37.06 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  37.06 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  37.06 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  38.16 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.71 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  37.06 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  36.71 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  36.71 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.71 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.36 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  40.32 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  33.33 
 
 		 259 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  40.32 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  40.32 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.86 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.47 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.47 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.47 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  36.47 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  31.3 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0088  periplasmic binding protein  38.19 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1305  periplasmic binding protein  38.77 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1439  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, periplasmic siderophore binding protein  38.43 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0617961  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0754  FecB protein  29.57 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.036257  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  30.83 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1140  periplasmic binding protein  38.08 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  30.74 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6720  periplasmic binding protein  36.93 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  34.23 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0570173 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4122  periplasmic binding protein  35.92 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  32.55 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.32 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4272  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  35.37 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0321448  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.18 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  33.08 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2777  periplasmic binding protein  31.46 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.49 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 363 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1103  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  30.88 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  31.3 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.35 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.71 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  31.63 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  27.97 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  27.15 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2421  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  29.47 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.73 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  40.16 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  23.97 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.24 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>