167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2423 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  38.49 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  30.91 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.65 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  28.73 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.54 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.72 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.04 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.99 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.69 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 662 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.27 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.09 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.09 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.72 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.36 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.36 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.01 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.49 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.67 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.26 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.72 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3319  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  26.32 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4339  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein FitE  26.32 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.99 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0374  ferrichrome ABC transporter substrate-binding protein  24.65 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  22.58 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  23.96 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  19.92 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  22.81 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  25.13 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.09 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 353 aa  52.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 373 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.05 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  25 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  30.85 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  22.63 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>