255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 
349 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  44.84 
 
 
341 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  38.57 
 
 
349 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  33.54 
 
 
373 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  35.24 
 
 
361 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  39.35 
 
 
662 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40.33 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  37.7 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  35.71 
 
 
342 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  36.69 
 
 
341 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.3 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  40.2 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  33.03 
 
 
346 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.49 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  34.29 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  35.67 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  34.77 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  39.08 
 
 
354 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  35.91 
 
 
324 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  33.24 
 
 
347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  37.83 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.24 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  32.27 
 
 
365 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  33.11 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.9 
 
 
358 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  30.43 
 
 
316 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  35.86 
 
 
325 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  35.96 
 
 
344 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
332 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  36.08 
 
 
359 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  34.02 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
347 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  33.92 
 
 
343 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  36.68 
 
 
347 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  31.37 
 
 
350 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  33.77 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  37.84 
 
 
349 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  33.77 
 
 
359 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  33.44 
 
 
359 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.96 
 
 
356 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  31.88 
 
 
325 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  32.99 
 
 
351 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  31.88 
 
 
325 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.65 
 
 
348 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  32.54 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  31.88 
 
 
338 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  31.69 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  32.39 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  34.47 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  29.74 
 
 
365 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  33.11 
 
 
338 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 
321 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
321 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
321 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  29.57 
 
 
339 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  32.13 
 
 
315 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
316 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  28.41 
 
 
330 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  27.68 
 
 
318 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  32.45 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.39 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.62 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.54 
 
 
322 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.4 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  33.5 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  26.28 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.85 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.94 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.94 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  24.91 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.38 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.38 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.92 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.93 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.43 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  22.43 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.43 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.67 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  22.43 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  25.61 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.56 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  21.81 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.22 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  27.86 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.95 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  31.06 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
316 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  21.81 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  30.81 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  29.55 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  22.55 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>