195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2749 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  100 
 
 
314 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  37.41 
 
 
310 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 
347 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  29.19 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
662 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
365 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  26.96 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.82 
 
 
322 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.82 
 
 
322 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.77 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.39 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.12 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.12 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  26.54 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  27.56 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  27.74 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  28.42 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  25.61 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.23 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.51 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.85 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.23 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.23 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  29.06 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  28.52 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.72 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  29.28 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  29.23 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  29.28 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  29.28 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  29.28 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  28.95 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  28.01 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.51 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  26.35 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  26.26 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  25.5 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.78 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  26.69 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  29.63 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.33 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  27.91 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  22.98 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.31 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  25.94 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
365 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  28.29 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  25 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  23.82 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  23.43 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.5 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  22.9 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  22.67 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  22.9 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  25.24 
 
 
354 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  22.04 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  23.46 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  24.3 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  22.04 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  22.04 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.28 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.22 
 
 
349 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  23.44 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  35.77 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.69 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.82 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  26.1 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  29.27 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.06 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.06 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  28.96 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  25.94 
 
 
359 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.6 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  21.05 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.73 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  21.81 
 
 
351 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.23 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.15 
 
 
314 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>