189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0270 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 321 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  100 
 
 		 321 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  100 
 
 		 321 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  69.09 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  67.72 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  59.45 
 
 		 330 aa  364  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  40.69 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  38.98 
 
 		 662 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  32.56 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  32.74 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  36.63 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  36.68 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.82 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  35.64 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  29.7 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.54 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  34.42 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.12 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  30.86 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  31.51 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  31.54 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.18 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  28.9 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 365 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  32.14 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  28.9 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  29.14 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.99 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  30.91 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.96 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.91 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  28.19 
 
 		 347 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  32.32 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  31.52 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.71 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  27.97 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  26.8 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.57 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  31.74 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.17 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.17 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  31.79 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  32.94 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  33.96 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  31.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  31.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  31.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  31.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  31.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.8 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  31.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  31.74 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  32 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.81 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  31.74 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  31.74 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.74 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.74 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  33.14 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.18 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.18 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.5 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.35 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.65 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>