196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 
353 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  46.05 
 
 
359 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  46.05 
 
 
359 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  46.05 
 
 
359 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  46.69 
 
 
346 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  46.06 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  45.48 
 
 
316 aa  282  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  45.17 
 
 
347 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  43.73 
 
 
350 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  40.86 
 
 
352 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  37.76 
 
 
349 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  38.72 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  35.07 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  38.6 
 
 
342 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  37.27 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  38.64 
 
 
341 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  33.53 
 
 
361 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  32.86 
 
 
354 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
325 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.95 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  33.55 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.19 
 
 
347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  35.79 
 
 
345 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  34.45 
 
 
333 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  34.65 
 
 
324 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.21 
 
 
383 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  32.46 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  33.66 
 
 
325 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
325 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.67 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  36.8 
 
 
351 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  34.78 
 
 
343 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.13 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  33.55 
 
 
351 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  32.67 
 
 
336 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  33.52 
 
 
349 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.75 
 
 
662 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.29 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  34.77 
 
 
322 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.06 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  33 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  34.16 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  34.66 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  32.66 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  32.66 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  33.75 
 
 
359 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  32.11 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  33.22 
 
 
344 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  33.21 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  29.53 
 
 
330 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  29.89 
 
 
339 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  31.38 
 
 
316 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
338 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  33.63 
 
 
357 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  30.3 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  27.74 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.89 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.08 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.84 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.84 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  26.54 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.02 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.02 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.02 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.86 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  25.16 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.18 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.18 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
298 aa  62.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  28.99 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.86 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  28.99 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  25.71 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.86 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.18 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.44 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.32 
 
 
318 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  28.62 
 
 
318 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  26.33 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.5 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  32.97 
 
 
323 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  24.44 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  24.61 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.2 
 
 
309 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>