187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3061 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  100 
 
 		 325 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  99.01 
 
 		 325 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  81.17 
 
 		 324 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  67.71 
 
 		 333 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  63.08 
 
 		 332 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  61.92 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  64.09 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  61 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  55.66 
 
 		 346 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  42.72 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  42.81 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  37.85 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  35.85 
 
 		 373 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.33 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.49 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  39.53 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  36.16 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.41 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  34.87 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.9 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.98 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  32.67 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  32.65 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  32.59 
 
 		 662 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  33.88 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  33.88 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.88 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.96 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.22 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  34.44 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  32.78 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  32.57 
 
 		 356 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  31.54 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  33.88 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  32.14 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.56 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  30.43 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.5 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  33.72 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.64 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  24 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.64 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  26.69 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.64 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.58 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3501  periplasmic binding protein  35.66 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.897036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  27 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.81 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.44 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  31.1 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.44 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  31.1 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.44 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  31.1 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  31.1 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  31.52 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.44 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  32.12 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.15 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  31.1 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  32.03 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  31.52 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  30.97 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  36.03 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>