182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2085 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  100 
 
 
354 aa  709    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  51.51 
 
 
347 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  49.83 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  44.07 
 
 
346 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  41.74 
 
 
333 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  45.7 
 
 
325 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  44.34 
 
 
354 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  43.56 
 
 
332 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  42.26 
 
 
324 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  42.72 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  42.72 
 
 
325 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  38.17 
 
 
373 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  35.84 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  35.57 
 
 
361 aa  212  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.21 
 
 
383 aa  202  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  33.62 
 
 
365 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.24 
 
 
346 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  35.96 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  34.63 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.55 
 
 
358 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  36.73 
 
 
341 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  35.1 
 
 
350 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  34.83 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.33 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.49 
 
 
349 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  31.97 
 
 
341 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  35.29 
 
 
662 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  31.67 
 
 
359 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  31.67 
 
 
359 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  31.33 
 
 
359 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  33.66 
 
 
316 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  33.43 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.43 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.61 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  31.12 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  30.26 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  29.94 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
359 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  35.15 
 
 
356 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  29.87 
 
 
338 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.33 
 
 
349 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  27.9 
 
 
351 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  30.09 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.86 
 
 
356 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
344 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  26.65 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
330 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  34.16 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  28.36 
 
 
351 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  29.21 
 
 
349 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  27.63 
 
 
338 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  30.32 
 
 
315 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
321 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  32.32 
 
 
321 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  32.32 
 
 
321 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  28.83 
 
 
316 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  27.33 
 
 
318 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  29.12 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  27.83 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.77 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.53 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  26.95 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  26.77 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  24.19 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  24.32 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  31.11 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.75 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.58 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  23.55 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  24.08 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.26 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.75 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  23.51 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.75 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  23.51 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  23.51 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  23.51 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  23.51 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.73 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.91 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  24.5 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  25 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  23.83 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  24.16 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.38 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.38 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  28.43 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.38 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  23.91 
 
 
298 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  26.01 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  27.37 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  24.52 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>