229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0375 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  79.17 
 
 
316 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  68.04 
 
 
321 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  68.04 
 
 
321 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  68.04 
 
 
321 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  54.18 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  40.34 
 
 
351 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  36.98 
 
 
662 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.93 
 
 
345 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  36.95 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  34.6 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  30.67 
 
 
338 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  34.37 
 
 
344 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  30.4 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  35.27 
 
 
347 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  41.95 
 
 
359 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  38.18 
 
 
349 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  30.89 
 
 
365 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  33.22 
 
 
373 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  33.43 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  30.91 
 
 
361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  36.61 
 
 
322 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.65 
 
 
353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.13 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
341 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  29.85 
 
 
346 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  36.45 
 
 
330 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.18 
 
 
358 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  32.73 
 
 
338 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
359 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  28.62 
 
 
359 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  30.23 
 
 
333 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  28.62 
 
 
359 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  28.83 
 
 
316 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  30.28 
 
 
316 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  30.56 
 
 
365 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  29.15 
 
 
354 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  33.04 
 
 
351 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  34.03 
 
 
354 aa  99.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.71 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.12 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.13 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  29.19 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  33.95 
 
 
342 aa  96.3  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.51 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  32.98 
 
 
349 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  34.86 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  27.93 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  29.24 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.94 
 
 
383 aa  92.8  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  31.6 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
332 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  29.08 
 
 
334 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  32.88 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  26.57 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  30.65 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.71 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.33 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  32.57 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  32.2 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  34.62 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  32.2 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.62 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.97 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.97 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  33.97 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.37 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.86 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.86 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.86 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.86 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.86 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.86 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  34.64 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  25 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  30.92 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  28.85 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  33.97 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  32.57 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  32.08 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  31.58 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  31.58 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  25.52 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  25.52 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.41 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.11 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.11 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  33.77 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  32.53 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  29.39 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>