160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0428 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  100 
 
 		 342 aa  667    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  41.91 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.44 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  37.57 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.67 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  35.56 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  34.2 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  38.58 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  36.67 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.51 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  34.01 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 373 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.52 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  33.93 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  37.11 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  35.41 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.61 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  36.3 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  35.39 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  32.52 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  31.79 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  33.77 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  32.13 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  32.13 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  31.8 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.77 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.49 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  36 
 
 		 662 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.88 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.85 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.6 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  33.88 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  34.93 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  33.06 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  35.14 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  37.28 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  34.08 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  32.42 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  31.78 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  31.15 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  33.75 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  31.9 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  31.51 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  27.98 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  32.04 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  24.01 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  24.01 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.39 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  24.01 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  24.01 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  28.97 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3083  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  23.4 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.66 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.74 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.74 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.32 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  24.55 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.02 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  24.01 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.99 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  23.55 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.77 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  23.53 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  21.89 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  29.15 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>