257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2753 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1370  periplasmic binding protein  69.18 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2424  periplasmic binding protein  69.84 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  31.12 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.64 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  35.06 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  34.07 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2426  periplasmic binding protein  28 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  30.32 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  33.54 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  33.11 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  29.17 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  34.84 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3083  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  27.56 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.65 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30.85 
 
 		 662 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.19 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.84 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  32.88 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  27.55 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  30.97 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.56 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.48 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.98 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.1 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.09 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  29.3 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  27.32 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.81 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.32 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.18 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  28.66 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.19 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.72 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.72 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  29.61 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.49 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.49 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.58 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  26.16 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.99 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 363 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.99 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  28 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.49 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  28.1 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  28.1 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  28.1 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  28.1 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  28.1 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  28.1 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  28.39 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.14 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  29.05 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  27.74 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>