272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1370 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1370  periplasmic binding protein  100 
 
 		 321 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  69.18 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2424  periplasmic binding protein  61.44 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  32.92 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  36.25 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  30 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  30 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  32.76 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2426  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.22 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3083  periplasmic binding protein  31.22 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  33.53 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  31.61 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  33.12 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  36.97 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  26.17 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  26.11 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.21 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  29.61 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  32.58 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  30.67 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  32.28 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  32.5 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.08 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.86 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  29.05 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.08 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  30.82 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.1 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  28.1 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.55 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  33.6 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.6 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.35 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  27.6 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  22.6 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  27.57 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.08 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.92 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.53 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  27.32 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  28.09 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.54 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.09 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  21.77 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3583  periplasmic binding protein (iron-binding protein)  33.33 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.76 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.32 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.97 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.97 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  25.45 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.97 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1776  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.67 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.97 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  34.15 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  27.74 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.76 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.6 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  26.78 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 313 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  27.09 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  27.75 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>