194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3501 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3501  periplasmic binding protein  100 
 
 
322 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.897036  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30.54 
 
 
662 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  33.44 
 
 
341 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  33.77 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  32.26 
 
 
344 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  27.8 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  26.78 
 
 
373 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.97 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.19 
 
 
322 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.75 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.58 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.19 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  31.82 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.1 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  32.21 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.9 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.9 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.9 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  26.26 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.87 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.9 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  31.37 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.51 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  27.91 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  29.12 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.83 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  29.8 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  28.88 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  28.21 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  27.11 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  25.57 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  22.61 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  23.91 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.95 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  21.79 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  28.38 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  34.23 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.97 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.37 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  22.79 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  22.79 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  22.79 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  22.79 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  22.79 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  22.44 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.53 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  22.12 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.13 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  30.07 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  28.06 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  32.69 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.7 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.81 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.81 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.81 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.81 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  27.62 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  29.34 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.95 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.38 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  27.23 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  29.74 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  33.69 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  33.51 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  30.92 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.67 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.67 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.67 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.67 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
349 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.67 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.08 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  26.09 
 
 
351 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  24.54 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.49 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  29.89 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.08 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  22.34 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  26.24 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.08 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.08 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>