275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1451 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  100 
 
 
338 aa  656    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  62.61 
 
 
337 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4084  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  44.83 
 
 
320 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00166295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  45.73 
 
 
318 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  45.73 
 
 
318 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  45.73 
 
 
318 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  45.73 
 
 
318 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  45.73 
 
 
318 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  45.39 
 
 
318 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  45.39 
 
 
318 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  45.39 
 
 
318 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  45.05 
 
 
318 aa  225  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3150  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  48.54 
 
 
362 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00953436  hitchhiker  0.00000000531618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  44 
 
 
319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.96 
 
 
318 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.96 
 
 
318 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.84 
 
 
319 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  46.18 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.96 
 
 
318 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.96 
 
 
318 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.62 
 
 
318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.12 
 
 
359 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.12 
 
 
359 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.83 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.36 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.99 
 
 
312 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.01 
 
 
351 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.28 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  37.2 
 
 
348 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1804  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.18 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.32 
 
 
325 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  29.22 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  27.52 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.3 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  27.13 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  25.99 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.1 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  27.83 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  33.5 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
662 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.84 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  33.82 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  29.9 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  29.01 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  31.82 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.4 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.37 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.78 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.08 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  24.89 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.16 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.47 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19520  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.5 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.26 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.47 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.47 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  28.65 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.79 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  29.44 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.93 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  32.23 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28.12 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.09 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  32.23 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  32.23 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.5 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.5 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.21 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.5 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.51 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.51 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  25 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.21 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.21 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.21 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.57 
 
 
336 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.21 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.93 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.21 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  25.93 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.93 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.93 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1049  periplasmic binding protein  28.18 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.93 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>