62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3150 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3150  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 362 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00953436  hitchhiker  0.00000000531618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  74.45 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4084  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  69.12 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00166295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1804  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  67.9 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3531  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  56.83 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0143  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.27 
 
 		 337 aa  229  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3034  periplasmic binding protein  42.91 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3052  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.91 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0643  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.91 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0494  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.55 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.55 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0612  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.55 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00559  iron-enterobactin transporter subunit  42.55 
 
 		 318 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00548  hypothetical protein  42.55 
 
 		 318 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0677  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.55 
 
 		 318 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3422  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.18 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0919226  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0690  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.07 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1124  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  42.03 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.200162  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0706  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.07 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0647  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.07 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0633  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.07 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0969796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0752  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  41.07 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1451  periplasmic binding protein  48.54 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0070828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1631  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  43.01 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.653172  normal  0.561829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3728  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.49 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.696478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1499  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  39.86 
 
 		 351 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0305  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  38.97 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0249  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.76 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.811563  hitchhiker  0.00112024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0617  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.76 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0698  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  33.44 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1328  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  36.59 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3696  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  22.02 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  22.54 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2423  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929009  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.4 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  22.84 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  23.64 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4280  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.39 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0936488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  23.38 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1721  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.78 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4291  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.07 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4374  periplasmic binding protein  23.42 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4786  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.07 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.36 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.11 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0833615  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4441  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.07 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4660  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.07 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4238  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0582  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.42 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.818084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4655  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.42 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  32.99 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.64 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>