158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2358 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2358  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 
132 aa  259  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.859502  normal  0.0379693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  46.9 
 
 
112 aa  103  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1078  putative hydrogenase nickel incorporation protein  40.54 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0654843  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.53 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.55 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.55 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0474  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.635429  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.64 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.94 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.94 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.94 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.84 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.64 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.64 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.73 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  31.82 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.56 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.96 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2619  hydrogenase expression/synthesis HypA  37.84 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.43 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36.28 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  30.97 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.73 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.23 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.17 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.18 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.45 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.74 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.31 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.36 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.21 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.97 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.74 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.05 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2156  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.462739  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0505  hydrogenase expression/synthesis, HypA family  33.04 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.03 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  30 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1382  hydrogenase expression/formation protein HypA  37.38 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00630275  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.91 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.55 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.25 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.09 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1308  hydrogenase nickel insertion protein HypA, putative  32.56 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000254152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.11 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2006  hydrogenase expression/formation  32.73 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321644  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.82 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.97 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3821  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.73 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631833  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.57 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3107  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3810  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.93 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.86 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.45 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.26 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.06 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.63 
 
 
136 aa  52  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.88 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.14 
 
 
115 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.36 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.82 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.51 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.2 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.22 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.09 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.86 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3166  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.46 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0373089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.59 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.89 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.59 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  26.55 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  31.86 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2541  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  25.66 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00349  hydrogenase expression/formation protein HypA  31.11 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.58 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.14 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50490  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  29.09 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00363931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.82 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.03 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.83 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.35 
 
 
138 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  25.76 
 
 
133 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.79 
 
 
128 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1931  hydrogenase nickel incorporation protein  27.27 
 
 
113 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350795  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0533  putative hydrogenase expression/synthesis protein HypA  31.86 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.3 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>