148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1330 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1330  phosphatidylserine decarboxylase related protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  40.1 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  38.12 
 
 		 208 aa  140  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  41.24 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  38.83 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  39.59 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  38.42 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.39 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  34.87 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.12 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  33.67 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  33.83 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  40.2 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  36.5 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  36.68 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.74 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  36.55 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  34.33 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  35.45 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.63 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.55 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  38.64 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  38.55 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  39.02 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 224 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  34.83 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  34.68 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  38.92 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  34.29 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  36.72 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  30.88 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  37.99 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.98 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  34.97 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  36.16 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  38.29 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  36.72 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  36.72 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  38.29 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  37.71 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  36.16 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  36.16 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.66 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.66 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  36.16 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  35.57 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  34.36 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.15 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.15 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.66 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.66 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3390  Phosphatidylserine decarboxylase  34.12 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  38.33 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  32.5 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  36.59 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2518  phosphatidylserine decarboxylase  37.22 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.619064  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  31.84 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  32.5 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  32.21 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  33.83 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  32.5 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.71 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  32.84 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  35.87 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  34.07 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  34.27 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  34.87 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  34.52 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  31.19 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.47 
 
 		 225 aa  97.1  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  33.71 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.47 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.2 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  33.52 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  32.57 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.34 
 
 		 233 aa  94.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  33.67 
 
 		 221 aa  94.4  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.97 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  32.64 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  29.95 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5233  Phosphatidylserine decarboxylase  31.86 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 		 232 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0348  phosphatidylserine decarboxylase  32 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0565253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  32.04 
 
 		 233 aa  91.3  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  33.68 
 
 		 232 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  32.21 
 
 		 248 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  33.68 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  35.12 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>