161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0248 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  45.75 
 
 
230 aa  191  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.17 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  42.01 
 
 
226 aa  179  4e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  42.11 
 
 
225 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  39.73 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  41.63 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  40.09 
 
 
226 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  39.23 
 
 
232 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  39.23 
 
 
232 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.11 
 
 
237 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  42.03 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  43.48 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  42.03 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.93 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.41 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  39.61 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.48 
 
 
232 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  41.23 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.15 
 
 
237 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  39.34 
 
 
247 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  41.06 
 
 
248 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  40.19 
 
 
232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  38.46 
 
 
232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  38.81 
 
 
232 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 
232 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 
232 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.15 
 
 
233 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  40.41 
 
 
225 aa  157  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  39.62 
 
 
231 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.25 
 
 
219 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  44.12 
 
 
212 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.35 
 
 
236 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.35 
 
 
236 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.35 
 
 
236 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  37.84 
 
 
262 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.89 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  41.35 
 
 
233 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  38.36 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  42.57 
 
 
216 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  41.49 
 
 
218 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  37.22 
 
 
232 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  42.57 
 
 
216 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  42.57 
 
 
216 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  42.57 
 
 
216 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  42.08 
 
 
216 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  42.08 
 
 
216 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  42.08 
 
 
224 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  42.08 
 
 
216 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  40.47 
 
 
224 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  41.15 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  41.63 
 
 
212 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  43.82 
 
 
213 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  41.67 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  37.56 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  35.14 
 
 
232 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
214 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3585  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  35.85 
 
 
236 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  41.85 
 
 
252 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  34.56 
 
 
220 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  45.35 
 
 
215 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  40.67 
 
 
212 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  42.29 
 
 
212 aa  142  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4866  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.11 
 
 
241 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  45.18 
 
 
213 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  44.77 
 
 
214 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  38.05 
 
 
208 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  44.19 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  38.35 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  42.44 
 
 
215 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  40.61 
 
 
212 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  40.96 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  42.44 
 
 
215 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  44.44 
 
 
217 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  41.86 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  39.55 
 
 
218 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  38.5 
 
 
219 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  42.93 
 
 
194 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.39 
 
 
223 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  37.63 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0676  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.46 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  37.43 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.91 
 
 
221 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.91 
 
 
221 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0607  phosphatidylserine decarboxylase  38.33 
 
 
235 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0585  phosphatidylserine decarboxylase  38.33 
 
 
235 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0594  phosphatidylserine decarboxylase  38.33 
 
 
252 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.04 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.94 
 
 
217 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  42.26 
 
 
220 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>