156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0554 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
217 aa  167  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  41.98 
 
 
218 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  38.94 
 
 
208 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  39.17 
 
 
226 aa  162  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.57 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  42.73 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  45.67 
 
 
213 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
226 aa  160  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
232 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  44.17 
 
 
232 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.56 
 
 
236 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.56 
 
 
236 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.63 
 
 
236 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.25 
 
 
225 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  42.27 
 
 
212 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  42.03 
 
 
232 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.71 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  40.19 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  41.75 
 
 
232 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  41.5 
 
 
212 aa  154  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  41.75 
 
 
212 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  46.15 
 
 
233 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
215 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
247 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.34 
 
 
233 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  38.03 
 
 
216 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  40.19 
 
 
248 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0594  phosphatidylserine decarboxylase  42.78 
 
 
252 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0607  phosphatidylserine decarboxylase  42.78 
 
 
235 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0585  phosphatidylserine decarboxylase  42.78 
 
 
235 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.17 
 
 
236 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  40.78 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  41.62 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.81 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  37.73 
 
 
232 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  37.73 
 
 
232 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  40.38 
 
 
213 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  38.76 
 
 
232 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  35.48 
 
 
232 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.28 
 
 
237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  38.25 
 
 
214 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
224 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
216 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  40.72 
 
 
218 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
216 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
216 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.65 
 
 
235 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  35.48 
 
 
232 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
224 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  39.72 
 
 
232 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  41.36 
 
 
219 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  37.33 
 
 
214 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  37.33 
 
 
214 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  42.37 
 
 
219 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 
214 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  37.33 
 
 
214 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  38.79 
 
 
232 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  38.28 
 
 
215 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  38.79 
 
 
230 aa  148  5e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  39.18 
 
 
217 aa  148  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.5 
 
 
225 aa  148  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  37.81 
 
 
215 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4866  phosphatidylserine decarboxylase related protein  47.85 
 
 
241 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  37.98 
 
 
225 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  39.22 
 
 
212 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.81 
 
 
218 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  37.8 
 
 
217 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  45.34 
 
 
208 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.6 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.23 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  38.54 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  37.8 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.7 
 
 
205 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  41.26 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  36.45 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  41.84 
 
 
218 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 
220 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  41.29 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
215 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  39.3 
 
 
233 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  39.44 
 
 
232 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  38.81 
 
 
216 aa  144  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  39.44 
 
 
232 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  36.41 
 
 
232 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3709  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37 
 
 
240 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0242942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  38.46 
 
 
262 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  42.51 
 
 
252 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  40.74 
 
 
225 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.5 
 
 
232 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  43.35 
 
 
216 aa  141  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  39.38 
 
 
220 aa  141  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  39.13 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  41 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  36.71 
 
 
214 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>