155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1996 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  44.44 
 
 
212 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.3 
 
 
223 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  41.36 
 
 
219 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  44.95 
 
 
212 aa  168  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  41.71 
 
 
212 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  42.13 
 
 
212 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  44.19 
 
 
213 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  43.52 
 
 
220 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  44.21 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  42.11 
 
 
217 aa  161  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 
224 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  38.53 
 
 
216 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  47.76 
 
 
205 aa  158  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  40.09 
 
 
216 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.55 
 
 
219 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  41.74 
 
 
212 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.64 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  47.67 
 
 
225 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  41.94 
 
 
219 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  44.8 
 
 
257 aa  151  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3556  phosphatidylserine decarboxylase  42.73 
 
 
219 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.23 
 
 
217 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
232 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  38.12 
 
 
218 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  41.94 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  43.52 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  38.12 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  41.59 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  38.74 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  41.55 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  40.55 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  38.99 
 
 
215 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  42.33 
 
 
247 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  38.99 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  38.99 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  40.91 
 
 
232 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  40.09 
 
 
212 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  39.53 
 
 
214 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  42.59 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  40.45 
 
 
232 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  39.91 
 
 
208 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  38.89 
 
 
218 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  42.79 
 
 
232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  39.55 
 
 
212 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  39.91 
 
 
213 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  39.09 
 
 
217 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 
217 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  42.92 
 
 
232 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.36 
 
 
237 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  42.22 
 
 
252 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  39.39 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  42.45 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  41.36 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  42.25 
 
 
232 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  40.47 
 
 
226 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.12 
 
 
232 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  41.79 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  39.46 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  36.77 
 
 
226 aa  138  6e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.67 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.67 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  37.04 
 
 
218 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.38 
 
 
237 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  38.81 
 
 
232 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.61 
 
 
236 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  36.64 
 
 
225 aa  136  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  38.81 
 
 
232 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  41.12 
 
 
232 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  38.14 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.7 
 
 
237 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  46.78 
 
 
233 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  39.55 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  39.55 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.81 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  38.18 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  35.02 
 
 
208 aa  132  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.18 
 
 
236 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.18 
 
 
236 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  41.15 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.56 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 
219 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  40.72 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>