154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0043 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  62.39 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  60.73 
 
 		 223 aa  274  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  60.28 
 
 		 216 aa  261  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  60 
 
 		 216 aa  256  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  59.17 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  57.87 
 
 		 217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3556  phosphatidylserine decarboxylase  55.96 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  58.66 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_002950  PG0965  phosphatidylserine decarboxylase  41.82 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.196296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  37.96 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.36 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.73 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  39.35 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  36.57 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  36.57 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.5 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  41.67 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  42.47 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  41.1 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  38.01 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.84 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  36.87 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  42.94 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  45.73 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  37.16 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.95 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  41.41 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.67 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.01 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.01 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  38.92 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  42.17 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  44.12 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  43.65 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  36.74 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.44 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  36.82 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  43.09 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  38.7 
 
 		 252 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  37.1 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  38.01 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  36.82 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  37.22 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  38.01 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.67 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  36.2 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.16 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  40.57 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  35.45 
 
 		 232 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.78 
 
 		 236 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  38.43 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  39.44 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  42.77 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  42.77 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  36.07 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  38.92 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  36.82 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  35.87 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4866  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.77 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  35.45 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  42.44 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  34.24 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  42.93 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.72 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.72 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  36.36 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  36.36 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  35.59 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  35.45 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  33.79 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0676  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.31 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  35.14 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  38.46 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  33.18 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>