155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0915 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 194 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  89.01 
 
 		 217 aa  354  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  74.87 
 
 		 215 aa  297  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  73.82 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  73.3 
 
 		 215 aa  294  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  70.16 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  70.16 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  69.63 
 
 		 214 aa  278  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  70.53 
 
 		 216 aa  277  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  68.59 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  70 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  70 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  70 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  69.47 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  69.47 
 
 		 216 aa  274  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  69.47 
 
 		 216 aa  274  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  69.47 
 
 		 216 aa  274  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  68.95 
 
 		 212 aa  273  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  68.42 
 
 		 212 aa  273  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  67.89 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  69.47 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  69.15 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  64.25 
 
 		 208 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  58.33 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  58.33 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  50.53 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  53.49 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  53.71 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  52.2 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  48.31 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  51.52 
 
 		 213 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  50.54 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  47.8 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  49.72 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  47.06 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  49.19 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  50.27 
 
 		 232 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  50.27 
 
 		 232 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  50.84 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  48.35 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  47.89 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  46.7 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48.9 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  46.88 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  48.9 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  47.87 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48.4 
 
 		 236 aa  168  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  47.25 
 
 		 233 aa  168  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  49.45 
 
 		 232 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48.4 
 
 		 236 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48.59 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.73 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  46.7 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  45.99 
 
 		 219 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  45.69 
 
 		 232 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  48.35 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  48.35 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48.35 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  49.44 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  46.35 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  48.89 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  46.52 
 
 		 232 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  46.07 
 
 		 248 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  45.7 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  48.17 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  45.7 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  46.03 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  44.39 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  49.15 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  45.03 
 
 		 247 aa  161  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.9 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  45.45 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  45.79 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  50.3 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  48.57 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  42.29 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  49.45 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.57 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  40.96 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.74 
 
 		 237 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  44.77 
 
 		 213 aa  151  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  45.93 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  39.77 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  38.3 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  42.94 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3585  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  44.15 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  45.4 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  42.29 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4866  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.96 
 
 		 241 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0594  phosphatidylserine decarboxylase  43.53 
 
 		 252 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0607  phosphatidylserine decarboxylase  43.53 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0585  phosphatidylserine decarboxylase  43.53 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  42.47 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  45.29 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  42.86 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  41.48 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0676  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.74 
 
 		 246 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>