149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3216 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  70.05 
 
 		 217 aa  325  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  67.14 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  62.33 
 
 		 215 aa  288  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  61.03 
 
 		 213 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  59.91 
 
 		 213 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  49.75 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  48.31 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  48.8 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  48.8 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  48.8 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  48.8 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  51.23 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  48.33 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  48.33 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  48.33 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  48.08 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  50.25 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  50.25 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  49.26 
 
 		 212 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  49.75 
 
 		 212 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  48.33 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  53.49 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  47.83 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  52.31 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  48.15 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  47.83 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  50 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  53.98 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.19 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  43.72 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  45.33 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  49.28 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  44.19 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  49.03 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  49.03 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  44.24 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  52.94 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  52.45 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  43.72 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  47.83 
 
 		 248 aa  177  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.79 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  48.06 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  49.76 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.74 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  47.83 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  45.74 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  42.79 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  52.76 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  47.14 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  46.57 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  50.86 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.54 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  42.92 
 
 		 262 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  46.45 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  48.31 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  43.18 
 
 		 257 aa  167  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  44.04 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.24 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  44.04 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.24 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  51.38 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  43.93 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.19 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  44.81 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  47.76 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  47.76 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.95 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  43.98 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  43.06 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.98 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  42.38 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.79 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  43.69 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  45.5 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  41.2 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.52 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.52 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  41.84 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  41.87 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3585  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  42.58 
 
 		 236 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  42.44 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  42.65 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.45 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.35 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  43.11 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  38.57 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  39.71 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  45.71 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  41.41 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>