153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2597 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
217 aa  436  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  68.52 
 
 
216 aa  307  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  64.95 
 
 
216 aa  290  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  57.87 
 
 
219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  56.81 
 
 
220 aa  238  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  57.8 
 
 
217 aa  231  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  58.66 
 
 
223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  55.88 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3556  phosphatidylserine decarboxylase  54.84 
 
 
219 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0965  phosphatidylserine decarboxylase  42.33 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.196296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  45.78 
 
 
235 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
212 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  38.21 
 
 
212 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  39.89 
 
 
208 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  36.79 
 
 
212 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  43.21 
 
 
208 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
214 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
214 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  37.91 
 
 
215 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
224 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  42.94 
 
 
226 aa  135  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
216 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  40.62 
 
 
217 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  39.07 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  41.04 
 
 
214 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  36.97 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  36.92 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.91 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  36.97 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  42.13 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.91 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.91 
 
 
236 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 
215 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.1 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  38.03 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  37 
 
 
212 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  36.53 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.6 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.6 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  39.38 
 
 
219 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.91 
 
 
237 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  38.6 
 
 
232 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  39.9 
 
 
219 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  39.36 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  36.67 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  39.88 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  38.14 
 
 
232 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  37.21 
 
 
232 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  39.89 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  36.28 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.46 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.91 
 
 
218 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.99 
 
 
236 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  36.99 
 
 
262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  40.11 
 
 
226 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  38.14 
 
 
232 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  42.46 
 
 
252 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  37.62 
 
 
220 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  38.6 
 
 
232 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  34.88 
 
 
218 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  38.16 
 
 
230 aa  123  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  38.14 
 
 
232 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  38.81 
 
 
257 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.41 
 
 
225 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  41.46 
 
 
214 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  38.95 
 
 
219 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  42.51 
 
 
225 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  35.35 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  37.36 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  36.45 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  35.35 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  42.51 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  36.28 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  39.07 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4866  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.23 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  34.91 
 
 
213 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0676  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.94 
 
 
246 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  42.07 
 
 
220 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  42.07 
 
 
220 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  33.02 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  37.26 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  37.32 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  35.71 
 
 
215 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  43.29 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
225 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  34.74 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>