170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0348 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0348  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0565253  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  38.42 
 
 
208 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  35.96 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  36.14 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  35.47 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  36.14 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  33.5 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  36.14 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  34.87 
 
 
212 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  38.3 
 
 
212 aa  123  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  37.04 
 
 
212 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  34.78 
 
 
218 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  34.98 
 
 
232 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  36.67 
 
 
203 aa  121  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.66 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.65 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.57 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  35.29 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  34.39 
 
 
219 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  34.01 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  33.99 
 
 
231 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  35 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  35.53 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.67 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  32.65 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  35.03 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  32.65 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  33.86 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.67 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  34.23 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.04 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  34.29 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  36.22 
 
 
214 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  35.5 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.51 
 
 
237 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  36.04 
 
 
225 aa  115  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  35.64 
 
 
232 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  32.51 
 
 
232 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.72 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  32.43 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  35.64 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  32.43 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.5 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  32.29 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0965  phosphatidylserine decarboxylase  36.65 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.196296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.66 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.17 
 
 
237 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  32.74 
 
 
233 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.2 
 
 
232 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  36.46 
 
 
217 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  32.32 
 
 
233 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  32.98 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  35.45 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  35.56 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  35.11 
 
 
232 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
224 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  32.8 
 
 
216 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  32.02 
 
 
232 aa  112  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.33 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.23 
 
 
232 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  30.85 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  32.45 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  34.01 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  34.57 
 
 
232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  33.84 
 
 
219 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  32.65 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  32.51 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  32.18 
 
 
218 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  35.39 
 
 
213 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  32.65 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  32.65 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  34.97 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  35.48 
 
 
230 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  30.81 
 
 
221 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  30.81 
 
 
221 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2518  phosphatidylserine decarboxylase  34.52 
 
 
210 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.619064  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
226 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  35.71 
 
 
233 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  31.75 
 
 
212 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  34.69 
 
 
225 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>